Phú Thạnh là xã mới hình thành những năm sau ngày Miền nam hoàn toàn giải phóng thống nhất đất nước.
Trước năm 1975, Phú Thạnh là một ấp thuộc xã Phú Lâm, nằm dọc theo Sông Tiền có chiều dài khoản 3,5km, từ cây số 15 đến số 18 rưỡi (Ranh dưới kho phân Năm Thành hiện nay).
Theo Quyết định số 181/CP, ngày 25 tháng 4 năm 1979 của Hội đồng Chính phủ, xã Phú Thạnh chính thức được thành lập có chiều dài 4km từ cây số 15 đến mương số 19.